解析：
方法一：由题意，分别赋值步行、跑步、骑车的速度为1、2、4，则对步行与骑车应用等距离平均速度的公式可知其平均速度为，以此速度从A到B城用时为1小时，因此跑步从A到B城用时为小时（距离相等，时间比等于速度反比），即48分钟。公式：等距离平均速度（、分别为往返速度）。
方法二：由题意可知步行、跑步、骑车的速度之比为1∶2∶4，则直接赋值速度分别为1、2、4，设A、B两城之间的距离为。则根据题意有，解得S=，因此跑步从A城到B城用时为小时，即48分钟。
故正确答案为B。