解析：
根据题意，该患儿方颅、血钙6.5mg/L（＜4mg/L），常有不伴发热的惊厥，综上所述该患儿考虑维生素D缺乏性手足搐搦症（D对）。查血糖3.2mmol/L（正常值≥2.2mmol/L），所以排除低血糖症（A错）。该患儿的血镁为1mg/dl，低于1.4mg/dl，但是低镁血症主要表现为肌肉颤动，且结合枕秃、方颅的病史，排除低血镁症引起的痉挛（E错）。该患儿为方颅，可能为先前缺乏维生素D导致的骨骼改变，结合不发热的惊厥表现，应认定为维生素D缺乏性手足搐搦症伴维生素D缺乏性佝偻病，但主要以维生素D缺乏性手足搐搦症为主，有维生素D缺乏性佝偻病史（C错）。