解析：
第一步：找出定义关键词。
“证明与被反驳命题相矛盾的命题为真”、“确定被反驳命题为假” 。
第二步：逐一分析选项。
A项：甲说人类是由猿猴进化而来，乙说的“有哪一个人见过哪一只猴子变成了人”是从肯定所要反驳的命题为真而引出了一个荒谬的结论，没有猴子变成了人，属于归谬法，不符合定义，排除；
B项：甲说的“天不生仲尼，万古如长夜”意指孔子没有诞生的话，中国人的文化史将如漫漫长夜一般黑暗，其矛盾命题应该是：孔子没诞生的话，中国人的文化史也不会像漫漫长夜一般黑暗。乙说的“难道仲尼以前的人都生活在黑暗中？”讨论的并不是文化史而是人们的生活，和甲说的话题不一致，不是甲所说的矛盾命题，不符合定义，排除；
C项：乙说的“人性本恶”属于肯定所要反驳的命题为真，从而得到“道德规范从何而来”这样一个荒谬的结论，属于归谬法，不符合定义，排除；
D项：乙说的“温饱不是谈道德的先决条件”是甲说的“温饱是谈道德的先决条件”的矛盾命题，“古往今来，没有解决衣食之困的社会也在谈道德”证明了“温饱不是谈道德的先决条件”命题为真，属于通过证明与被反驳命题相矛盾的命题为真，从而确定被反驳命题为假的方法，符合定义，当选。
故正确答案为D。