解析：
此题考查成语的语境搭配和不同侧重点辨析。
题干用“一方水土一方人，一方人筑一方城”指出原因，“城市风貌千姿百态”是其逻辑结果，两句之间存在逻辑的顺承。“顺理成章”比喻某种原因合乎逻辑或常理发生某种结果，强调的是合乎逻辑或常理，与题干逻辑结构符合，D项正确。
“顺其自然”强调的是不人为干涉事物发展进程，但题干讲的是城市风貌的形成，这与人的活动密切相关，故不选；“水到渠成”本义指水流过的地方自然形成一条水道，引申为只要条件成熟，事情自然会成功，强调的是条件要充分，故不选；“司空见惯”比喻本来有些奇怪的事情，现在大家看惯了也就不觉得奇怪了，不符语境。故不选。
故正确答案为D。