解析：
维系蛋白质分子一级结构的化学键是肽键（B对）和二硫键（C对），其中肽键起主要作用，本题最佳答案为B。维系蛋白质分子二级结构的化学键是氢键（P14）（D错）。维系蛋白质分子三级结构的化学键是疏水键（P19）（E错）、盐键、氢键和范德华力。维系蛋白质分子四级结构的化学键是氢键和离子键（P19）（A错）。