解析：
这是一道合同管理与应用的题，主要考核施工合同文件的组成与解释顺序的知识点。对于具备合同管理经验、熟悉相关法律法规知识的考生，此题不难。
根据《建设工程施工合同（示范文本）》GF－1999－0201 “第二部分通用条款”的2.1条规定，施工合同文件的组成及解释顺序如下：
（1）施工合同协议书（双方有关的工程洽商、变更等书面协议或文件视为协议书的组成部分）；
（2）中标通知书；
（3）投标书及其附件；
（4）施工合同专用条款；
（5）施工合同通用条款；
（6）标准、规范及有关技术文件；
（7）图纸；
（8）工程量清单；
（9）工程报价单或预算书。
施工合同文件各组成部分应能够互相解释、互相说明。当合同文件中出现不一致时，上述顺序就是合同的优先解释顺序。当合同文件出现含糊不清或者当事人有不同理解时， 按照合同争议的解决方式处理。
由此可见，本题的正确选项应为“B．施工合同协议书、中标通知书、投标书及其附件、施工合同专用条款”。
注：《建设工程施工合同（示范文本）》GF－1999－0201已更新为《建设工程施工合同（示范文本）》GF－2013－0201。