解析：
违反《母婴保健法》及其实施办法规定进行胎儿性别鉴定的，应由卫生行政部门给予警告，责令停止违法行为；对母婴保健机构直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予行政处分。该医师违反《母婴保健法》擅自实施胎儿性别鉴定，当地卫生计生行政部门应对该医师给予行政处分（B对）。