解析：
肾盂肾盏内鹿角形结石形成后，可长期刺激尿路移行上皮，引起上皮的慢性炎症，导致鳞状上皮化生甚至继发尿路上皮恶变（C对），此为最严重后果。尿路梗阻、尿路感染、肾积水和尿毒症均为鹿角形结石的并发症。尿路梗阻（A错)和肾积水（D错）待结石取出后可以消除；尿路感染（B错）经取石、抗感染治疗后也可痊愈；尿毒症（E错）患者对侧肾大多可以代偿或通过透析维持，以上并发症均可通过治疗而好转，故不是患者最严重的后果。