解析：
小正方体每个面的面积为，大正方体每个面的面积为，两个正方体的总面积为，其中重合部分为两个小正方体的面，面积为，而大正方体作为旗台，其底面不用粉刷，故需要粉刷的面积为。
故正确答案为D。