解析：
2008年4月12日，胡锦涛在三亚会见来访的澳大利亚总理陆克文时表示：“西藏事务完全是中国内政。我们和达赖集团的矛盾，不是民族问题，不是宗教问题，也不是人权问题，而是维护祖国统一和分裂祖国的问题。”所以“西藏问题”的实质是主权问题。
故正确答案为D。