解析：
第一步：将选项逐一代入，判断各选项前后部分的逻辑关系。
A 项：书本是知识的载体，分析理论是动宾关系；
B 项：学习知识、分析结论都是动宾关系；
C 项：学问与知识是近义词，分析是对一件事情进行分门别类的整理，研究是探索、钻研，二者没有明显的逻辑关系；
D 项：学生学习知识，主宾关系，研究员分析，主谓关系。
第二步：逻辑关系相同即为答案。
根据第一步可知，逻辑关系完全相同的是B 项。
故正确答案为B。