解析：
第一步：抓住定义中的关键词。
关键词包括“保护生态或自然环境恶劣”，“整体迁出”。
第二步：逐一判断选项。
A项中该地区村民被迁往他乡完全符合关键词，因此属于生态移民；
B项中居民为躲避战争迁到南方，不符合关键词“保护生态或自然环境恶劣”，因此不属于生态移民，而是战争移民；
C项中村民集体移居山外是因为交通十分不便，不符合关键词“保护生态或自然环境恶劣”，因此不属于生态移民；
D项中张三的父母到上海与张三一起居住，是个体移居，不符合关键词“整体迁出”，因此不属于生态移民。
故正确答案为A。