解析：
文段开篇指出隐形战机的隐形原理是通过设计和涂层来实现，接着通过转折关联词“但是”提出隐形战机因为要考虑材料、造价、维护等多方面因素，因而在设计中受到诸多限制，后文通过“因此”进行总结，即隐形战机受设计限制影响，不可能实现全隐身，隐身能力受限。故文段的重点是强调隐形战机在设计中存在的不足和缺陷，对应B项。
A项，“制造隐形战机的困境”偷换概念，文段强调的是在实现全隐身方面遇到的困境，并非“制造”阶段的困境，排除。
C项，“技术难点”对应“受现有技术和材料水平以及战机制造难度……等诸多限制”，属于诸多受制条件中的一个方面，片面，且属于“因此”之前的表述，非重点，排除。
D项，“隐身原理”对应第一句话，非重点，且“原理”属于中性表述，文段强调的是隐身战机存在的设计“缺陷”，不匹配文段表达的感情色彩，排除。
故正确答案为B。
【文段出处】《米波三坐标雷达：让隐身战机无处可藏》