解析：
第一空，与前文“长期积累”对应可知，这一套方法、流程、标准和机制应是相对“系统”、“成熟”、“普遍”的，D项“先进”无法构成对应。且根据后文“虽然有单一乃至僵化的缺陷”可知，这些机制都存在问题，“先进”强调领先和进步，与“缺陷”语义矛盾，排除D项。
第二空，根据转折词“但”可知，前后语义相反，转折前阐述了传统纸媒存在缺陷，填入的成语应表示传统纸媒还是发挥了重要作用的含义。A项“无独有偶”是指并非只此一个，还有一个可以和它配成一对的，表示两事或两人十分相似，至少得有二者，文段只提及传统媒体，排除。
第三空，根据后文“这是媒体安生立命之本” 可知，文段强调具有高度专业水平的内容是任何媒体必须具有的，B项“不可或缺”符合要求。C项“独一无二”是指没有相同的或没有可以相比的，文段并非强调独特性，且“独一无二”用在此处程度过重，排除C项。
故正确答案为B。
【文段出处】《必然衰落 不会消亡——传统媒体未来》