解析：
文段首先提出“建筑设计，是一个科学问题，也是一个民主决策问题”这一观点，接下来通过“但是”进行转折，由后文“遵循民主决策、公开决策的原则”可知，文段重在强调“民主决策问题”，而“专业人士的意见”代表科学，故第一空，应填入体现“科学”的词语，因此不能选择单方面直接“采纳”或“采用”专业人士意见，排除C、D两项。
第二空，搭配“艺术创新”，A项“保障”、B项“保护”用在此处均可。
第三空，“吸纳意见”为固定搭配，通过一系列的渠道将公众诉求体现在“建筑设计”中而非仅仅停留于“征集”的表面工作上，故“吸纳”更符合文意，排除A项。
故正确答案为B。
【文段出处】人民日报 《尊重规划权威才能告别奇怪建筑》