解析：
本题为语句排序题，从选项入手。首先判断首句，②句是对文段的论述对象“金鱼”总括性的介绍，⑥句是具体介绍金鱼的原产地，故②句应为首句，排除D项。由“尽管……却……”的关联词语可知，⑥④应紧密相连，且顺序为⑥在④之前。④句的“没有多少证据证实它们是什么时候被驯养的”意为金鱼的驯养时间不确定，③句以“不过”开头，说明有一件事情是可以确定的，故③应紧接④后，表示虽然金鱼的具体驯养时间不确定，但是大概的范围不会超过一千年，据此排除A、B两项。
故正确答案为C。