解析：
与细菌的呼吸作用有关的结构是中介体（A对），中介体是细菌部分细胞膜内陷、折叠、卷曲形成的囊状物，细菌的细胞膜类似于真核细胞的线粒体，在细胞呼吸和能量代谢中发挥重要作用，中介体能够扩大细胞膜面积，增加酶含量，从而促进细菌的呼吸作用。包涵体（B错）形成于受病毒感染的细胞内，可以是病毒颗粒的聚集体、病毒增值留下的痕迹或是病毒感染引起的细胞反应物，与病毒的增殖、存在有关（P222）。吞噬体（C错）是吞噬细胞与病原体结合后，接触部位细胞膜内陷，并吞噬病原体包绕而形成，能够消化处理病原体，不参与呼吸作用（P74）。线粒体（D错）是真核生物的细胞结构，细菌为原核生物，无线粒体。异染颗粒（E错）是白喉棒状杆菌的生物学特性，主要成分是核糖核酸和多偏磷酸盐，对于细菌的鉴定具有重要意义，与细菌的呼吸作用无关（P164）。