解析：
根据应用指南中的内容，表明存在值得关注的内部控制缺陷的迹象举例如下：
（1）控制环境无效的证据，例如：
①与管理层经济利益相关的重大交易没有得到治理层适当审查；
②识别出被审计单位内部控制未能防止的管理层舞弊（无论是否重大）（选项B）；
③管理层未能对以前已经沟通的值得关注的内部控制缺陷采取适当的纠正措施
（选项D）。
（2）被审计单位内部缺乏通常应当建立的风险评估过程（选项A）。
（3）被审计单位风险评估过程无效的证据。例如，管理层未能识别出注册会计师预期被审计单位的风险评估过程应当识别出的重大错报风险。
（4）没有有效应对识别出的特别风险的证据（如缺乏针对这种风险的控制）。
（5）注册会计师实施程序发现的、被审计单位的内部控制未能防止或发现并纠正的错报。
（6）重述以前公布的财务报表，以更正由于错误或舞弊导致的重大错报（选项C）。
（7）管理层无力监督财务报表编制的证据。