解析：
第一步：判断题干词语间逻辑关系。
微量元素是指研究体系中含量小于的元素，稀有金属是指在自然界中含量较少或分布稀散的金属，故二者为交叉关系；铜是微量元素，二者为种属关系，且铜不是稀有金属。
第二步：判断选项词语间逻辑关系。
A项：木本植物和草本植物都是植物的一种，二者为并列关系，与题干逻辑关系不一致，排除；
B项：海洋动物和哺乳动物为交叉关系，但北极熊是哺乳动物，不是海洋动物，与题干逻辑关系不一致，排除；
C项：内陆湖和淡水湖为交叉关系，青海湖是内陆湖，二者为种属关系，且青海湖不属于淡水湖，与题干逻辑关系一致，当选；
D项：节肢动物和两栖动物为并列关系，且鳄鱼不属于节肢动物，与题干逻辑关系不一致，排除。
故正确答案为C。